Рыбохозяйственный комплекс Калининградской области является самым молодым в России. Его становление началось в 1945 году с создания Балтгосрыбтреста. В октябре 1949 года было создано Управление экспедиционного лова, суда которого начали промысел сельди в Северном и Норвежском морях.

Основными направлениями развития рыбохозяйственного комплекса Калининградской области являются океаническое рыболовство, прибрежное рыболовство, аквакультура, наука и образование.

В 2013 году началась реализация государственных мер поддержки предприятий прибрежного лова, что положительно сказывается на состоянии добывающей базы и береговой инфраструктуры. Посредством государственной поддержки производится модернизация флота и береговой инфраструктуры. При условии сохранения данной тенденции к 2020 году Калининградская область будет иметь береговую инфраструктуру, способную быстро и качественно принять и обработать улов.

В январе 2014 года была принята государственная программа Калининградской области «Развитие рыбохозяйственного комплекса». Ее целью является формирование условий для устойчивого развития рыбохозяйственного комплекса Калининградской области на основе повышения конкурентоспособности вырабатываемых товаров и услуг, рационального использования водных биоресурсов, их выращивания и воспроизводства.

Исполнение программы будет осуществляться в один этап – с 2014 по 2020 годы.

Программа будет реализовываться посредством целевых программ Калининградской области: «Развитие прибрежного рыболовства в Калининградской области на 2013-2020 годы» и «Развитие аквакультуры в Калининградской области на 2013-2015 годы», а также отдельных мероприятий программы таких как:

- Совершенствование государственного управления в сфере океанического рыболовства,

- Организация рыболовства и сохранение водных биоресурсов,

- Обеспечение управления и реализации государственной программы.

Программа утверждает основные задачи в рыбохозяйственном комплексе Калининградской области:

1) устойчивое увеличение производства рыбной продукции из сырья, добытого и (или) произведенного компаниями Калининградской области;

2) обеспечение рационального и эффективного использования ресурсной базы;

3) оказание государственных услуг и управление в сфере установленных функций.

Реализация мероприятий программы будет способствовать социально-экономическому развитию рыбохозяйственного комплекса области, сделав его привлекательным в инвестиционном отношении, обеспечив необходимой инфраструктурой, создав условия для эффективного использования ресурсной базы и рационального освоения выделенных квот.

Со своими предложениями в разработке программы приняли участие рыбодобывающие компании, Союз рыбопромышленников Запада, Западно-Балтийское территориальное управление Росрыболовства, ФГБОУ ВПО «Калининградский государственный технический университет», Калининградский областной союз рыболовецких колхозов, ФГУП «АтлантНИРО» и ФГУП «Запбалтрыбвод».